曹州牡丹的传说很多，1999年菏泽地区政协工委主任黄爱菊同志编辑出版了一本《曹州民间故事》，搜集编入该书的有魏紫的传说、舍命保赵紫、黑牡丹的传说、牡丹园的传说等。
郜效珠所作《魏紫的传说》记载了这样一个故事：
是说明洪武年间，曹州一个名为赵义的年轻人，虽生活贫苦但生性善良，一次，他将自己的饭让给了一位老妇，老人回赠其牡丹。
后赵义用卖花的钱买米分给穷人，又将余钱交还给老妇。老妇见赵义品行端正，就刨了一棵牡丹让他带回家栽种。
此牡丹化为美人与赵义成亲，一起辛勤栽培出多种牡丹，时人称之为“百花园”。
如今位于菏泽牡丹区的百花园种植很多几十年乃至上百年牡丹品种，是菏泽牡丹花会的重要牡丹景点。
蔡中方的《黑牡丹的传说》中介绍说：
曾经曹州城东有一孤儿叫曹黑丹，三十岁才娶妻，俩人以栽培各色牡丹为生，却唯独没有黑牡丹。
一白须老翁在梦中指点他，到火焰山取黑丸可用以培养黑牡丹。
曹黑丹经历奇遇取得丹丸，回到家却发现妻子已死，一园子牡丹也都枯死了，只有妻子坟上一株白牡丹还活着。
曹黑丹的眼泪化开了丹丸，落在白牡丹根上，白牡丹开出了黑花，成了黑牡丹。
曹黑丹死后与妻子合葬，墓前又生出一株黑牡丹，两株牡丹紧紧偎依着，如同并蒂莲，这两株黑牡丹成双成对地繁衍，成为曹州牡丹园里一个独特的品种。
从 《聊斋志异》里《葛巾》的故事可知，民间牡丹早于京师，洛阳牡丹源于曹州，故至今曹州牡丹种植面积之大、品种之多、开发用途之广，仍属世间无二。